Het Comenius Museum is gewijd aan het leven en het werk van de beroemde Tsjechische geleerde Jan Amos Comenius (1592-1670) die in Naarden is begraven.Het museum en de laatste rustplaats van Comenius bevinden zich in een voormalig klooster in de vesting van Naarden.
De nieuwe vaste tentoonstelling ‘Mundus Comenii’ (De wereld van Comenius) geeft inzicht in het leven en de werken van Comenius. In de bibliotheek zijn werken van en over Comenius ondergebracht.Het mausoleum waarin Comenius begraven ligt, is tevens een rijksmonument.